第一是調理飲食，不能少食，亦不能過飽。﹁食若過飽，則會脹氣，百脈不通，心情不開朗，坐不住；若食過少，則身瘦易生病心臟無力，思考不靈光。﹂
第二是調理睡眠。打坐煉功不能貪圖睡眠。如果睡眠過多，就無法體會虛空境界，亦會喪失以往所修的功夫，心智亦不開。故貪睡不僅會荒廢禪定功夫，且會使得心靈麻木。因此，要常常﹁控制睡眠，保持神氣清朗，時時迴光返照，常使心明淨。﹂也就是說，夜裡應少睡，多多堅持修習禪坐。
第三是調理身體。坐時要使身體安穩，不要有不平衡的狀態。若半跏坐，以左腳置右腳上，盡量令左腳指與右腿齊，或右腳指與左腿齊。這稱之為﹁半跏﹂。還有一種為﹁全跏﹂：﹁即正右腳與左腳交叉在上。所穿衣服不要太緊，寬鬆最好。次當安手，以左手掌置右手上，或右手置左手上，重疊相對，放在左腳或右腳上，靠近身，然後放心安坐。」接下來，還必須注意：「令脊骨勿太彎曲或勿太聳正。頭頸盡量不要下隋，令鼻與臍相對，不偏不斜，不低不昂。」當坐久腳會酸，可以換左右腳，不要硬撐，這會造成血液循環不良，而變成腳麻木。煉功不可太急，凡事都以漸進方式進行煉功為上。
第四是調理呼吸之息。具體的方法是：﹁吐、納氣之法，不可令氣粗或急，綿綿呼氣而出，想身體中百脈不通處，隨氣而出，使身息調和。次當閉口，唇齒相拄著。次當閉眼，斷外光。接下當端身正坐，猶如奠石。﹂這裏的吐氣要綿綿細長的呼吸，二要﹁閉眼﹂、﹁斷外光﹂。這兩點如同《胎息經》所說：﹁吐唯細細，納唯綿綿。﹂《樵陽經》說：﹁將雙眼微閉，垂簾觀照。﹂
調理呼吸功法最為重要，息有四種現象：一為風、二為氣、三為息、四為喘。有聲為風，無聲為氣，出入為息，氣出入不盡為喘也。﹂進一步闡釋：﹁息有分四種相：一風、二喘、三氣、四息。前三風喘氣為不調相，後面息為調相。
云何為風相？有聲為風。坐時則鼻中息出入覺有聲，是風也。
云何喘相？氣出入不盡為喘也。坐時息無聲而出入結滯不通，是喘相也。
云何氣相？無聲為氣。坐時息雖無聲，亦不結滯，而出入不細，是氣相也。
云何息相？出入為息。不豐中結不粗，出入綿綿，若存若亡，資神安穩，情抱悅豫，此是息相也。
守風則散，守喘則結，守氣則勞，守息即定。
總之，﹁風﹂、﹁氣﹂、﹁喘﹂三種呼吸方法皆有弊端，只有做到﹁不結不粗，出入綿綿﹂，即運用﹁息﹂的方法才是正確的。
第五是調理心態。調心方法比較複雜。簡單地說，一、即打坐中要攝心止念，不得胡思亂想；二、打坐禪定中要注重﹁沈﹂、﹁浮﹂、﹁寬﹂、﹁急﹂四種狀況。
何謂﹁沈﹂？﹁若坐時心中昏暗，無所記錄，頭常低垂，是為沈相。﹂醫治的方法是：﹁當計心繫念鼻端，令心住在中，無分散意，此可治沈。﹂
何謂﹁浮﹂？﹁若坐時心浮飄動，身亦不安，外念異緣，此是浮相。﹂醫治的方法是：﹁宜安心向下，繫念臍中，制諸亂念，心即定住，則心易安靜。﹂扼要地講，醫治﹁沈相﹂，應繫念鼻端；醫治﹁浮相﹂，應繫念臍中。
此外，還應注意﹁胸臆急痛﹂的﹁急病相﹂和﹁心志散慢﹂的﹁寬病相﹂。醫治前者的方法是：﹁當寬放其心，想氣皆流下，患自癒矣。﹂醫治後者的方法是：﹁應當斂身守中，令心住身中，以此為治。
出定收功的方法：﹁欲出定時，應前放心異緣，開口放氣，想從百脈隨意而散，然後微微動身，次動肩膊及手頭頸，次動二足悉令柔軟，次以手遍摩臉，次摩手令暖，以掩兩眼，然後開之，待身熱稍歇，方可隨意出入。﹂假如不按部就班地照這套程序收功，將會引起﹁頭痛﹂，關節酸痛，煩躁不安等弊病。
修行性命(神氣)入門方式有多種途徑。論其最重要的功法，不出止觀二法。止者乃伏氣結丹築基之初門，觀者是斷惑〈妄想〉之正要；止則愛養心識之善資，觀則策發神解之妙術；止是禪定之勝因，觀是智慧之由藉。若人成就定慧二法，斯乃自利利人，法皆具足。
故《法華經》云：﹁佛自住大乘，如其所得法，定慧力莊嚴，以此度眾生。﹂當知此之二法，如車之雙輪，鳥之兩翼。若偏修習，即墮邪道。
故經云：若偏修禪定福德，不學智慧，名之曰愚；偏學智慧，不修禪定福德，名之曰狂；狂愚之過雖小不同，邪見輪轉，蓋無差別。若不均等，此則行乖圓備，何能成登極果？
丹經云：若但離宮修定，不向水府求玄，則離宮陰神，猶是無而不有，虛而不實。縱靜中尋靜，深入杳冥之境，只得一個恍惚陰神樣子，終不能聚則成形，散則成氣。欲有則有，欲無則無，實實在在有個真跡也。故曰：﹁修性不修命，萬劫陰靈難入聖。﹂又有只知煉命者，但固守下田，保養元精。前此未聞盡性之功，後此但求伏氣之術，惟煉離宮陰精，使之化氣。復守腎間動氣，使之不漏，不知移爐換鼎，向上做煉氣化神功夫。雖胎田氣滿，可為長生不老人仙。然氣未歸神，神未伏氣。有時念慮一起，神行氣動，仍不免動淫生欲。故曰：﹁修命不修性，猶如鑒容無寶鏡。﹂必也性命雙修，務令一身內外，無處不是元精，無處不是元氣，到得精已化氣，無復有生精之時。
故經云：聲聞之人，定力多故，不見佛性；十住菩薩，智慧力多，雖見佛性，而不明了；諸佛如來，定慧力等，是故了了見於佛性。
以此推之，止觀是修煉性命神氣之要門，修行之勝路，眾德圓滿之指歸，無上極果之正體也。若如是知者，止觀法門是不可缺的一個重要心法。傳道法者欲接引初學之人，須詳細對初學者詳細解說入道之法。
